小頭畸形與正常比例圖

茲卡病毒與登革熱，黃熱病，日本腦炎和西尼羅河病毒有親屬關係。它會引發類似溫和的形式的登革熱的症狀，由休息與症狀治療，目前還無法通過藥物或疫苗來預防。茲卡病毒經由母親傳染給孩子，新生嬰兒感染此病毒可能導致小頭畸形，而成人感染可能影響神經系統，包括格林－巴利症候群亦可能有所關聯。

在2016年1月，美國疾病控制與預防中心（CDC）發布了受影響的國家名單，包括強化注意事項，建議孕婦考慮推遲旅行的旅行指南。其他國家的政府或健康部門也很快發出類似的旅行警告，而哥倫比亞，多明尼加共和國，厄瓜多，薩爾瓦多，牙買加建議女性推遲懷孕，直到更多的人知道其中的風險。

茲卡病毒有包膜呈二十面體，就像是與它有親屬關係的其他病毒，並且具有不分段，單股正鏈RNA基因組。這是與斯龐德溫尼病毒(Spondweni virus)密切相關的病毒，是斯龐德溫尼病毒病毒進化枝兩種病毒之一。

該病毒最早在1947年4月由黃熱病研究所的科學家從被放置在一個籠子中的獼猴分離出，地點在烏干達，維多利亞湖附近的茲卡森林[3]。隨後在1948年1月在同一地點，從非州斑蚊第二次被分離出來。在1952年當猴子出現發燒症狀，研究人員從它的血清中分離出傳播病原體，這是第一次描述為茲卡病毒。在1968年它首次從奈及利亞人分離出來。從1951年到1981年人類感染的證據是從其他非洲國家如中非共和國，埃及，加彭，獅子山，坦尚尼亞和烏干達，以及在亞洲的部分地區，包括印度，印度尼西亞，馬來西亞，菲律賓，泰國和越南都有報導。

茲卡病毒有非洲裔和亞洲裔兩個譜系。演化學研究顯示，在美洲蔓延的病毒與法屬玻里尼西亞的菌株密切相關。茲卡病毒的完整基因組序列已經公佈。從最近序列調查初步結果，在公共領域發現了一個在非結構蛋白1密碼子可能的變化，這可能會增加在人體中病毒複製的速度。